爱德华·埃利克(罗米·帕克饰)和弟弟阿尔方斯(钉子·巩俐饰)在艾姆斯·多利斯逗留期间,遇到了两个月后就能出狱的逃犯梅尔文(森川智之饰),结果发现对方拥有不亚于埃利克兄弟的强大炼金术。 根据梅尔文在狱中留下的线索,两兄弟前往西方大国古雷达调查。 在这里,他们的火车被一只神秘的黑蝙蝠袭击,同时他们遇到了朱莉娅·克莱顿(坂本真绫饰),梅尔文正在寻找的女孩。 一番混乱之后,他们来到了米洛斯,一个位于地下的贫穷小镇。 米洛斯是大国夹缝中的牺牲品,她的人民决定用圣星来复兴祖国和民族...这部电影改编自荒川弘的漫画原著。