小智和皮卡丘等伙伴在征途上前行。 一天,包和从天上掉了下来,被迫和小智关在一起。 波尔凯尼恩和被人类伤害过的神奇宝贝生活在一起,所以他非常讨厌人类,但是这条神奇的锁链让他们形影不离,奇妙的故事就此开始。 小智和皮卡丘将一起开始新的冒险...另一方面,在阿索特王国的超级风琴城,贾维斯部长得到了他常年追求的终极发明——诞生于500年前阿索特王国的人造宝藏,玛机雅娜的梦想。 据说在玛机雅娜有一种叫做“灵魂”的未知力量,贪婪邪恶的贾维斯试图用这种力量来统治这个王国。 肖智和波尔凯尼恩将如何解决他们的分歧?波尔凯尼恩和玛机雅娜的起源是什么?他们怎么能一起对抗贾维斯来拯救阿索特王国呢?玛机雅娜的最终命运会是什么?神奇宝贝历史上最伟大的战役之一即将开始!